Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CDKN3Q16667 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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