Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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NRF1Q16656 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
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NRF1Q16656 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NRF1Q16656 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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