Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TNXAQ16473 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms