Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
NTRK3Q16288 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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