Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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CNGA3Q16281 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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CNGA3Q16281 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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CNGA3Q16281 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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CNGA3Q16281 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
CNGA3Q16281 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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