Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AP000790.2-201ENST00000534388 522 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CCDC6Q16204 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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