Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 LINC02377-202ENST00000505436 523 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SNCBQ16143 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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