Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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