Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC117525.1-201ENST00000515228 503 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
ALX1Q15699 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALX1Q15699 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms