Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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BRD3Q15059 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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BRD3Q15059 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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BRD3Q15059 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
BRD3Q15059 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
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BRD3Q15059 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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BRD3Q15059 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
BRD3Q15059 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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