Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 OR52A5-201ENST00000307388 3973 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.52□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
LAPTM4AQ15012 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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