Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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SHPRHQ149N8 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SHPRHQ149N8 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
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SHPRHQ149N8 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SHPRHQ149N8 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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SHPRHQ149N8 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SHPRHQ149N8 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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SHPRHQ149N8 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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SHPRHQ149N8 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SHPRHQ149N8 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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SHPRHQ149N8 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
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SHPRHQ149N8 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SHPRHQ149N8 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
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