Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 CR769775.2-201ENST00000417850 891 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
CSHL1Q14406 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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