Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 HIPK2-202ENST00000406875 15049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL9A3Q14050 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL9A3Q14050 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL9A3Q14050 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
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