Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
GTF2H2Q13888 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms