Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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DDX39BQ13838 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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DDX39BQ13838 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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DDX39BQ13838 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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DDX39BQ13838 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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DDX39BQ13838 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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DDX39BQ13838 AC016903.2-201ENST00000456384 326 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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DDX39BQ13838 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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