Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 ST20-203ENST00000562759 694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CACNA1SQ13698 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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