Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
NEUROD1Q13562 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
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