Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC091179.1-201ENST00000461606 579 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C1orf61Q13536 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms