Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SMAD4Q13485 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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