Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
XRCC4Q13426 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
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