Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
PDE3BQ13370 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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