Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MIR5096-201ENST00000583713 70 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
AP3B2Q13367 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms