Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRIM28Q13263 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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