Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SRSF5Q13243 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.9 ms