Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NME3Q13232 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
NME3Q13232 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
NME3Q13232 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NME3Q13232 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms