Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC108471.2-204ENST00000526807 784 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC040904.1-201ENST00000590850 223 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LINC02337-201ENST00000401043 374 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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CSTF3Q12996 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
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CSTF3Q12996 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CSTF3Q12996 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
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