Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 LINC2194-202ENST00000567624 506 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 TOP2A-201ENST00000423485 5758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PTP4A2Q12974 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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