Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
GRIN2AQ12879 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
GRIN2AQ12879 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms