Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 TARID-205ENST00000607033 2960 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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PGGT1BP53609 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PGGT1BP53609 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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