Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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HOXA2O43364 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
HOXA2O43364 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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