Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CRXO43186 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL583856.2-201ENST00000606298 543 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CRXO43186 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CRXO43186 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CRXO43186 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CRXO43186 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CRXO43186 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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