Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
VGFO15240 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
VGFO15240 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
VGFO15240 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VGFO15240 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VGFO15240 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VGFO15240 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
VGFO15240 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VGFO15240 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VGFO15240 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VGFO15240 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
VGFO15240 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
VGFO15240 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
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