Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC006512.2-201ENST00000543250 486 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
FAM53CQ9NYF3 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms