Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
SMG1Q96Q15 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms