Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NEDD1Q8NHV4 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.6 ms