Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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CLDN19Q8N6F1 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CLDN19Q8N6F1 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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