Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC011333.1-201ENST00000520587 436 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR6723-201ENST00000621981 89 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ENOX2-202ENST00000370927 3788 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC099560.1-201ENST00000412811 500 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SOX9-AS1-203ENST00000424417 576 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SCARNA18.2-201ENST00000516882 84 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ANKRD39Q53RE8 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.2 ms