Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 FHP1-201ENST00000442741 703 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
MSMPQ1L6U9 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
MSMPQ1L6U9 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms