Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC015917.1-201ENST00000579654 510 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
GEN1Q17RS7 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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GEN1Q17RS7 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
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GEN1Q17RS7 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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GEN1Q17RS7 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
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GEN1Q17RS7 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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GEN1Q17RS7 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
GEN1Q17RS7 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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