Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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CCDC142Q17RM4 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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CCDC142Q17RM4 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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CCDC142Q17RM4 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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CCDC142Q17RM4 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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CCDC142Q17RM4 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
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CCDC142Q17RM4 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
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CCDC142Q17RM4 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
CCDC142Q17RM4 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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