Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPROQ16827 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPROQ16827 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPROQ16827 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC122108.2-201ENST00000611946 526 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPROQ16827 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTPROQ16827 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTPROQ16827 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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