Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 KAT6B-202ENST00000372711 7560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 MAPK10-383ENST00000642032 3390 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 MR1-204ENST00000367580 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 SOHLH2-202ENST00000379881 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ERLIN2-211ENST00000523887 2347 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 NBPF19-206ENST00000621744 14425 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 TRAV8-4-201ENST00000390438 469 ntAPPRIS P1 BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL133244.1-201ENST00000456007 258 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 SERPINB8-208ENST00000542677 3192 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RASGEF1B-214ENST00000638048 2386 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 HYDIN2-203ENST00000614586 13885 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 CTNND1-223ENST00000529986 5727 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ATR-201ENST00000350721 8249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 IL31RA-201ENST00000297015 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 PLA2R1-201ENST00000283243 14371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 FGF10-201ENST00000264664 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC106785.4-201ENST00000569492 412 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ZNF33B-201ENST00000359467 5958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ATP10B-202ENST00000327245 7566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 PLEKHG1-201ENST00000358517 7138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
FOXD1Q16676 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms