Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
UBE3CQ15386 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
UBE3CQ15386 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.5 ms