Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
HERC3Q15034 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
HERC3Q15034 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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