Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
R3HDM1Q15032 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms