Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 MTND2P21-201ENST00000436242 1042 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 RAD1P2-201ENST00000446414 663 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CIRBPQ14011 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms