Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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