Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
CACNA1CQ13936 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
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