Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
DDX39BQ13838 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC063948.1-201ENST00000547360 379 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
DDX39BQ13838 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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